Амидаза (AMD)
Ферментүүд:Макромолекулын биологийн катализаторууд бөгөөд ихэнх ферментүүд нь уураг юм
Амидаза:Ацилийн бүлгийг ус руу шилжүүлж, чөлөөт хүчил, аммиак үйлдвэрлэх замаар янз бүрийн эндоген болон гадаад алифат, үнэрт амидуудын гидролизийг хурдасгана.Гидроксамик хүчил болон бусад органик хүчлүүд нь өсөлтийн хүчин зүйл, антибиотик, хавдрын дарангуйлагчийн бүрэлдэхүүн хэсэг учраас эм болгон өргөн хэрэглэгддэг.Катализаторын стереосонголтын дагуу амидазуудыг R ба S төрлийн ацилазад хувааж болно.
Амидаза нь амидын гидролизийг хурдасгахаас гадна гидроксиламин зэрэг субстратуудын оролцоотойгоор ацил дамжуулах урвалыг хурдасгаж чаддаг.
Өөр өөр эх үүсвэртэй амидаза нь өөр өөр субстратын өвөрмөц шинж чанартай байдаг бөгөөд тэдгээрийн зарим нь зөвхөн ароматик амидуудыг, зарим нь зөвхөн алифат амидуудыг, зарим нь α- эсвэл ω-амин амидуудыг гидролизлэх чадвартай байдаг.Ихэнх аминууд нь зөвхөн ациклик эсвэл энгийн үнэрт амидын хувьд сайн катализаторын идэвхжилтэй байдаг боловч нарийн төвөгтэй үнэрт бодисуудын хувьд гетероцикл амидууд, ялангуяа орто орлуулагчтай амидууд нь ерөнхийдөө бага идэвхжилтэй байдаг (цөөхөн хэдэн фермент илүү сайн каталитик нөлөө үзүүлдэг).
Каталитик механизм:
| Ферментүүд | Бүтээгдэхүүний код | Бүтээгдэхүүний код |
| Ферментийн нунтаг | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 амидазын багц, тус бүр 50 мг 19 зүйл * 50 мг / зүйл эсвэл бусад тоо хэмжээ |
| Шалгах хэрэгсэл (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 амидазын багц, 19 зүйл тус бүр 1 мг * 1 мг / зүйл |
★ Өндөр субстратын өвөрмөц чанар.
★ Хүчтэй хирал сонгомол.
★ Өндөр хувиргах үр ашиг.
★ Дайвар бүтээгдэхүүн бага.
★ Зөөлөн урвалын нөхцөл.
★ Байгаль орчинд ээлтэй.
➢ Ферментийн скринингийг субстратын өвөрмөц байдлаас шалтгаалан тодорхой субстратуудад хийж, хамгийн сайн катализаторын нөлөө бүхий зорилтот субстратыг катализатор болгодог ферментийг авах шаардлагатай.
➢ Өндөр температур, өндөр/бага рН, өндөр концентрацитай органик уусгагч зэрэг эрс тэс нөхцөлд хэзээ ч бүү хүр.
➢ Ердийн үед урвалын системд субстрат, буфер уусмал (ферментийн хамгийн оновчтой урвалын рН) байх ёстой.Гидроксиламин зэрэг хамтарсан субстрат нь ацил дамжуулах урвалын системд байх ёстой.
➢ AMD-ийг урвалын оновчтой рН ба температуртай урвалын системд хамгийн сүүлд нэмнэ.
➢ Бүх төрлийн AMD нь янз бүрийн оновчтой урвалын нөхцөлтэй байдаг тул тус бүрийг тусад нь судлах шаардлагатай.
Жишээ 1(1):
Төрөл бүрийн амид субстратуудад гидролизийн идэвхжил
| Субстрат | Тодорхой үйл ажиллагаа мкмоль мин-1mg-1 | Субстрат | Тодорхой үйл ажиллагаа мкмоль мин-1mg-1 |
| Ацетамид | 3.8 | ο-Өө бензамид | 1.4 |
| Пропионамид | 3.9 | p-Өө бензамид | 1.2 |
| Лактамид | 12.8 | ο-НХ2бензамид | 1.0 |
| Бутирамид | 11.9 | p-НХ2бензамид | 0.8 |
| изобутирамид | 26.2 | ο- Толуамид | 0.3 |
| Пентанамид | 22.0 | p- Толуамид | 8.1 |
| Гексанамид | 6.4 | Никотинамид | 1.7 |
| Циклогексанамид | 19.5 | Изоникотинамид | 1.8 |
| Акриламид | 10.2 | Пиколинамид | 2.1 |
| Метакриламид | 3.5 | 3-фенилпропионамид | 7.6 |
| Пролинамид | 3.4 | Индол-3-ацетамид | 1.9 |
| Бензамид | 6.8 |
Урвалыг 50 мм натрийн фосфатын буфер уусмал, рН 7.5, 70 ℃ температурт явуулав.
| Амидууд | Гидроксиламин | Гидразин |
| Ацетамид | 8.4 | 1.4 |
| Пропионамид | 18.4 | 3.0 |
| изобутирамид | 25.0 | 22.7 |
| Бензамид | 9.2 | 6.1 |
Урвалыг 50 мм натрийн фосфатын буфер уусмал, рН 7.5, 70 ℃ температурт явуулав.
Холбогдох урвалжийн концентраци: амид, 100 мМ(бензамид, 10 мМ);гидроксиламин ба гидразин, 400 мМ;фермент 0.9 мкм.
Жишээ 2(2):
Жишээ 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al.Процесс биохими, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al.Биорганик хими, 2017, Онлайнаар авах боломжтой 7.
